MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11 plasmid 5

Total Repeats: 87

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008507	TTG	2	6	31	36	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008507	T	6	6	48	53	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008507	ATA	2	6	64	69	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008507	ATTT	2	8	101	108	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008507	T	6	6	106	111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008507	AT	3	6	124	129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008507	T	7	7	129	135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008507	ATT	2	6	137	142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008507	ATT	2	6	144	149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008507	GTA	2	6	165	170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008507	GAT	2	6	183	188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008507	A	6	6	288	293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008507	ATTA	2	8	333	340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008507	AGA	2	6	394	399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008507	TCT	2	6	426	431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_008507	T	6	6	513	518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008507	TCG	2	6	632	637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_008507	TTGA	2	8	654	661	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008507	AAT	2	6	667	672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008507	TGA	2	6	700	705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008507	GAG	2	6	719	724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008507	GTA	2	6	808	813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008507	ATA	2	6	861	866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008507	AAAAC	2	10	880	889	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_008507	TG	3	6	2366	2371	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008507	TCC	2	6	2402	2407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_008507	A	7	7	2427	2433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008507	CAA	2	6	3052	3057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_008507	ATA	2	6	3161	3166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008507	AAT	2	6	3177	3182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008507	CAA	2	6	3204	3209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_008507	T	6	6	3274	3279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008507	A	6	6	4101	4106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008507	AT	3	6	4110	4115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008507	ATT	2	6	4152	4157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008507	TTA	2	6	4180	4185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008507	A	9	9	4195	4203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008507	TTA	2	6	4263	4268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008507	TAA	3	9	4271	4279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008507	CTT	2	6	5220	5225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_008507	TAT	2	6	11980	11985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008507	ATT	2	6	12010	12015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008507	T	6	6	12034	12039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008507	T	6	6	12056	12061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008507	T	6	6	12078	12083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008507	T	8	8	12122	12129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008507	AT	3	6	12154	12159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008507	T	6	6	12185	12190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008507	GGTCA	2	10	12343	12352	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_008507	AAC	2	6	12364	12369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008507	T	7	7	12404	12410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008507	ACA	2	6	12418	12423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008507	ATTCA	2	10	12428	12437	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_008507	A	6	6	12601	12606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008507	CAA	3	9	12687	12695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_008507	TAG	2	6	12706	12711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008507	TGAG	2	8	12723	12730	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008507	TAA	2	6	12835	12840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008507	CAA	2	6	12871	12876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_008507	AAAAT	2	10	13045	13054	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008507	TCTT	2	8	13065	13072	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_008507	AGA	2	6	13087	13092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008507	A	7	7	13092	13098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008507	TCT	2	6	13109	13114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_008507	T	6	6	13131	13136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008507	AACA	2	8	13152	13159	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_008507	GA	3	6	13166	13171	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008507	T	6	6	13172	13177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008507	GTTC	2	8	13178	13185	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_008507	TAA	3	9	13298	13306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008507	TGTA	2	8	13325	13332	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008507	CTTA	2	8	13372	13379	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_008507	TCA	2	6	13402	13407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_008507	A	6	6	13414	13419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008507	ATT	2	6	13516	13521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008507	ATC	2	6	13611	13616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_008507	TAG	2	6	13653	13658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008507	AT	3	6	13732	13737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008507	GAA	2	6	13741	13746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008507	ACA	2	6	13770	13775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_008507	ATT	2	6	13873	13878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008507	GT	3	6	13963	13968	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008507	AAT	2	6	13971	13976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008507	TGA	2	6	14037	14042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008507	GAA	2	6	14077	14082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008507	TG	3	6	14097	14102	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008507	GATAA	2	10	14153	14162	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.